Наиболее значительные архитектурные ансамбли создаются в Москве. На рубеже веков перестраиваются стены московского Кремля. Они возводятся из красного кирпича на белокаменном фундаменте. Длина крепостной стены достигала двух километров, толщина в некоторых местах - более 6 метров, а высота - от 5 до 19. Одним из крупнейших мастеров, работавших в России при Иване III, являлся итальянец по рождению Аристотель Фьораванти. Основное сооружение, созданное под его руководством - это Успенский собор в Кремле (1476 - 1479), созданный по образцу Успенского собора во Владимире. Архитектору удалось соединить традиции русского зодчества с новейшими достижениями европейских мастеров. Успенский собор стал главным собором России, местом проведения торжественных обрядов венчания на царство.
Домовая церковь московских великих князей (впоследствии - царей) - Благовещенский собор - была создана псковскими мастерами в 1484 - 1489 гг., усыпальницу русских правителей - Архангельский собор в 1505 - 1509 гг. создал мастер Алевиз Новый. В 1487 - 1491 гг. возводится Грановитая палата, предназначавшаяся для торжественных приемов.
Каменное строительство продолжалось и в XVI в. В 30-е гг. в Москве возводятся стены Китай-города. В конце века выдающийся русский мастер Федор Конь возводит стены Белого города длинной более 9 километров с 27 башнями. Федор Конь является также строителем практически неприступных укреплений Смоленска. Каменные крепости возводились в XVI в. также и в других городах: Нижнем Новгороде, Казани, Астрахани, Туле, Коломне, Зарайске и других.
С 30-х гг. XVI века начинается строительство шатровых храмов. Наиболее ранним образцом подобного стиля является церковь Вознесения в селе Коломенском (1532 г.). Особенностью храмов шатрового стиля является отсутствие внутренних столбов, а тяжесть здания опирается на фундамент. Самым выдающимся памятником архитектуры считается знаменитый собор Покрова на Рву, более известный как храм Василия Блаженного. Собор был создан в 1554 - 1561 гг. русскими зодчими Постником Яковлевым и Бармой в память о взятии Казани русскими войсками.